L’Unité Transversale de Production de Biologie Moléculaire (UTP-BM) de l’Institut de Biologie et Pathologie est une structure transversale dont la vocation est la réalisation d’actes de biologie moléculaire nécessaires aux diagnostics biologiques.
Cette plateforme technique regroupe des moyens nécessaires à l’extraction d’ADN et l’analyse génétique (PCR, PCR quantitative, analyse de fragments et séquençage Sanger). Depuis 2013 la plateforme s’est dotée d’un ensemble d’appareils permettant la réalisation de séquençage à Haut Débit, ou NGS (Next generation sequencing).
Les analyses de génétique moléculaire réalisées sur la plateforme recouvrent entre autres :
- Des diagnostics de maladies rares réalisées au sein de laboratoires agréés pour l’étude des caractéristiques génétiques des individus par l’Agence de la Biomédecine
- Des diagnostics et suivi thérapeutiques des cancers
- Des projets de recherches des différentes unités de l’IBP
La plateforme comprend :
- Un robot d’extraction d’ADN Perkin Elmer Janus Expanded
- Deux robots pipeteurs Perkin Elmer Janus dédiés à préparation des réactions de PCR et à la purification des réactions de séquence
- Un automate pipeteur Biomek 3000 pour la préparation du séquençage NGS
- Un parc d’appareils d’amplification PCR et de PCR-temps réel
- Un séquenceur ABI 3130
- Un séquenceur de nouvelle génération Ion Personal Genome Machine® (PGM™) System
- Un système Ion OneTouchTM
- Une plateforme de quantification et de qualification des acides nucléiques et des banques de séquençages NGS (Qubit® 2.0 Fluorimeter et Agilent ® 2100 bioanalyzer® instrument )